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据“联合新闻网”等台媒9月2日报道，8月31日，台北检方以涉贪污、违背职务受贿等罪名，向法院申请将台湾民众党主席、前台北市长柯文哲羁押禁见。9月2日凌晨3时许，台北地方法院裁定柯文哲无保请回（检察官或法院讯问被告后，不要求被告交担保金保证自己不会逃，讯问完就请被告自行离开）。柯文哲在走出法院后，对支持者表示，检察官搜索时查扣了手机跟硬盘，再拿里面的资料去编故事，“这两天可以说是极尽压迫跟凌虐”。
台北地方法院认为，按照目前的卷证资料，就检察官所提出事证，尚存有其他合理解释空间，尚未达“有犯罪之高度可能性”，因此尚不能认定被告柯文哲就彭振声、应晓薇等人主导台北市都委会形成违法决议的行为已有所知悉或指示，或被告柯文哲明知“20%容积奖励”系属违法，因而不能认定被告柯文哲主观上有明知违法（此为图利罪及受贿罪之共同要件）的情形。综上所述，应认定声请人就羁押要件中“犯罪嫌疑重大”之要件，其释明尚有不足。
柯文哲被裁定无保请回后，台北检方表示将提抗告。同案另一被告台北市前副市长彭振声则获准羁押禁见。
柯文哲步出法院台媒“联合新闻网”
台北地方法院作出上述裁定的时间是2日凌晨3时许，随后，柯文哲在同党“立委”黄国昌的陪伴下，走出法院，并向门外的群众发表约3分钟的谈话。
柯文哲首先对深夜来到现场的支持者们表示了感谢。
柯文哲接着表示，司法单位如果觉得有问题，可以向他发送信息，不需要在清晨搜索台湾地区主要在野党的主席住处及该党的中央党部。柯文哲表示，无法理解此举的目的是什么。
他指出，“检察官用搜索时查扣的手机跟硬盘，再拿里面的资料去编故事”。他强调，“这两天可以说是极尽压迫跟凌虐”。
柯文哲说，在最后答辩时，他直接跟法官说，京华城840%容积率，当年在送公开展览以后，再转送都市计划委员会，他完全没有过问，市长不会过问单一个案，直到今年3月、4月媒体开始报道，他才知道这个案子的容积率有840%。
“所以目前所有的证据，都没有显示说我有去干预这个案子，”柯文哲表示。
柯文哲说，他对法官表示，“从检察官这两天的询问方式，我已经知道他们的态度相当明确，所以我跟法官说，请你不要为难。其实这一次真正辛苦的是法官，他扛住了最后的压力”。
柯文哲最后对支持者表示感谢，并再次强调，“真的是法官扛住了所有的压力”。
此前，柯文哲被告发在台北市市长任内涉嫌台北京华城容积率弊案，台检廉单位近期持续侦办此案。
据台湾“中央社”报道，台北京华城容积率在柯文哲任内暴增到840%，外界质疑柯文哲“护航业者”。台北地检署今年5月分案侦办，将柯文哲等人列为被告，并要求“廉政署”进行搜查，约谈台北前副市长彭振声、台北市政府官员等人员。
8月30日早上7时，台北地检署和“廉政署”展开行动，对柯文哲住处进行搜查，柯文哲在当天中午接受了“廉政署”审讯。在经历12个小时“马拉松”式审讯后，柯文哲在31日凌晨被移送台北地检署复讯。但由于柯文哲拒绝夜间审讯并试图离开，他被检察官当庭逮捕。
柯文哲随后向法院申请提审，审查自己遭逮捕的过程是否合法。但台北地方法院在8月31日上午召开提审庭，裁定驳回柯文哲的提审申请，柯文哲又被送回台北地检署继续接受审讯。
台北地检署认为，柯文哲、彭振声二人涉嫌贪污、违背职务受贿等罪名，犯罪嫌疑重大，且有勾串共犯和证人的嫌疑，因此向台北地方法院申请将二人羁押禁见。
“中时新闻网”估计，自柯文哲遭到搜查，前往“廉政署”接受审讯，历经当庭逮捕、申请提审、检方申请羁押禁见，直到今晚8时法院召开羁押庭为止，柯文哲仅在“廉政署”、台北地检署和台北地方法院候审室三处地点就经历了约44个小时。
除了京华城案，柯文哲还身陷政治献金风波，以及被曝用选举补助款购买办公室。8月29日，柯文哲召开发布会鞠躬道歉，并宣布向民众党请假3个月，静待党内调查。
台媒“联合新闻网”发文称，过去一个月来，柯文哲的政治献金、选举补助款等金流疑云被有系统的爆料和在网络引导，几乎已将柯文哲舆论定罪。柯文哲和民众党面对质疑说不清，反让风暴不断扩大，台司法部门此时以侦办京华城弊案搜索约谈，更是一记重拳，让柯文哲和民众党溃不成军，民进党则“坐收渔翁之利”。
文章称，赖清德上任后，面对在野多数民意表现强硬。国民党和民众党“蓝白合作”监督民进党，已是唯一能制衡民进党的力量，如今民众党党内大乱，在野力量被撕裂，后续发展将牵动台湾地区未来政局。赖清德要小心节制权力，让司法公平公正审理，若磨刀霍霍用司法斗争在野党，必遭风暴反噬。